Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RAPGEF3O95398 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RAPGEF3O95398 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RAPGEF3O95398 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms