Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PPLO60437 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PPLO60437 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PPLO60437 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
PPLO60437 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PPLO60437 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PPLO60437 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PPLO60437 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PPLO60437 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PPLO60437 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PPLO60437 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PPLO60437 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PPLO60437 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PPLO60437 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PPLO60437 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PPLO60437 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PPLO60437 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PPLO60437 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PPLO60437 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PPLO60437 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPLO60437 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPLO60437 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPLO60437 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPLO60437 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPLO60437 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PPLO60437 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPLO60437 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPLO60437 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPLO60437 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPLO60437 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPLO60437 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PPLO60437 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPLO60437 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PPLO60437 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PPLO60437 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPLO60437 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPLO60437 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPLO60437 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPLO60437 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPLO60437 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPLO60437 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PPLO60437 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPLO60437 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PPLO60437 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PPLO60437 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PPLO60437 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PPLO60437 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PPLO60437 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
PPLO60437 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPLO60437 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPLO60437 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPLO60437 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPLO60437 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PPLO60437 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPLO60437 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPLO60437 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PPLO60437 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
PPLO60437 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPLO60437 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPLO60437 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPLO60437 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPLO60437 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPLO60437 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PPLO60437 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPLO60437 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPLO60437 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPLO60437 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPLO60437 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPLO60437 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPLO60437 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPLO60437 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPLO60437 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPLO60437 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PPLO60437 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PPLO60437 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PPLO60437 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PPLO60437 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PPLO60437 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PPLO60437 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PPLO60437 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PPLO60437 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PPLO60437 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PPLO60437 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PPLO60437 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PPLO60437 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PPLO60437 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PPLO60437 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PPLO60437 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PPLO60437 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PPLO60437 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms