Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP8B3O60423 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP8B3O60423 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms