Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GRIN3BO60391 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GRIN3BO60391 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GRIN3BO60391 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms