Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GATCO43716 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GATCO43716 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GATCO43716 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GATCO43716 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GATCO43716 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATCO43716 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATCO43716 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATCO43716 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATCO43716 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATCO43716 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATCO43716 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATCO43716 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GATCO43716 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GATCO43716 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATCO43716 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATCO43716 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATCO43716 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATCO43716 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATCO43716 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATCO43716 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GATCO43716 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GATCO43716 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GATCO43716 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GATCO43716 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms