Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSPAN6O43657 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN6O43657 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms