Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
I3L3M4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
I3L3M4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
I3L3M4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
I3L3M4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
I3L3M4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
I3L3M4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
I3L3M4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
I3L3M4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
I3L3M4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
I3L3M4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms