Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
B4DEV8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
B4DEV8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
B4DEV8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
B4DEV8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
B4DEV8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
B4DEV8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
B4DEV8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
B4DEV8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
B4DEV8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
B4DEV8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4DEV8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4DEV8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4DEV8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4DEV8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4DEV8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4DEV8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms