Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KNCNA6PVL3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KNCNA6PVL3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms