Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRIT2A6NDA9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LRIT2A6NDA9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms