Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBA6A0AVT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA6A0AVT1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBA6A0AVT1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms