Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY10

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY10 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0J9YY10 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A0A0J9YY10 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms