Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMG5Q9UPR3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMG5Q9UPR3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms