Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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CNTN3Q9P232 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CNTN3Q9P232 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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CNTN3Q9P232 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CNTN3Q9P232 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CNTN3Q9P232 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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