Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
GABARAPL3Q9BY60 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms