Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
RBBP8Q99708 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms