Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TCF23Q7RTU1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms