Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AL954722.1-201ENST00000431238 259 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CACNA1SQ13698 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
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