Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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PTPRJQ12913 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRJQ12913 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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