Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 MIR602-201ENST00000384960 98 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AL512444.1-201ENST00000419644 480 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC064862.6-203ENST00000605139 691 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 LINC00877-207ENST00000488545 1561 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PTPRMP28827 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 OAZ3-202ENST00000400999 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PTPRMP28827 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PTPRMP28827 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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PTPRMP28827 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PTPRMP28827 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PTPRMP28827 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PTPRMP28827 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PTPRMP28827 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PTPRMP28827 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRMP28827 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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