Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTGS1P23219 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms