Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 MYCBP-203ENST00000494695 750 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 TUBAP-201ENST00000425085 1352 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
DMDP11532 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AP001922.6-201ENST00000532553 546 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 GIMD1-201ENST00000507153 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC010442.2-201ENST00000509301 407 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AL033381.2-201ENST00000603854 732 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DMDP11532 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 GEMIN8-203ENST00000398355 1119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 PNLIPRP2-201ENST00000579578 1482 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 CAPG-204ENST00000409724 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 PDZD9-201ENST00000424898 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 PIGA-209ENST00000634582 965 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 ENO3-201ENST00000323997 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 SATB2-AS1-202ENST00000441234 468 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DMDP11532 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms