Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLF1Q9BQI6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLF1Q9BQI6 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms