Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GTF3C6Q969F1 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms