Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms