Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 HNRNPMP1-201ENST00000560685 1768 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 BSCL2-206ENST00000405837 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SKOR2Q2VWA4 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms