Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
IMPG1Q17R60 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 342.7 ms