Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL354707.1-201ENST00000615168 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PMS2P11Q13670 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms