Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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FOXD4Q12950 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FOXD4Q12950 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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