Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 NDRG4-201ENST00000258187 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 DNMT1-203ENST00000540357 4916 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SSBP1Q04837 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms