Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
POLR2FP61218 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms