Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM21P19474 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM21P19474 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms