Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GLI3P10071 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GLI3P10071 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MT1L-201ENST00000565768 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 HNRNPA1P68-201ENST00000425806 979 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 HERC2P5-202ENST00000564458 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 HERC2P8-203ENST00000564795 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GLI3P10071 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms