Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms