Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

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Length 1,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CLIP2Q9UDT6 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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