Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC50Q8IVM0 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC50Q8IVM0 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms