Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ZBED6P86452 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ZBED6P86452 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms