Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
ACTBP60709 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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ACTBP60709 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ACTBP60709 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ACTBP60709 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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