Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SNORA30.1-201ENST00000363193 129 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MRPL51-205ENST00000543164 814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MRPL51-206ENST00000543703 441 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 GOLGA2P10-201ENST00000550961 817 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 NPPB-201ENST00000376468 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC136698.1-201ENST00000558110 546 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC048382.4-201ENST00000559065 546 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 AL022725.1-201ENST00000436283 369 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMARCA2P51531 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms