Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGAEP38570 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms