Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MRPL23-203ENST00000397294 551 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 TPI1P2-201ENST00000491343 752 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC068134.4-201ENST00000613365 122 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 NRSN1-201ENST00000378475 800 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 KRTAP2-2-202ENST00000542910 390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 LINC00869-208ENST00000621156 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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PTPRMP28827 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 SVILP1-203ENST00000450581 486 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MOG-229ENST00000483013 279 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MOG-232ENST00000490427 327 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ZNF577-202ENST00000451628 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 ASPDH-201ENST00000376916 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPRMP28827 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
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