Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VTNP04004 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VTNP04004 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VTNP04004 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms