Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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GGTLC3B5MD39 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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GGTLC3B5MD39 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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GGTLC3B5MD39 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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GGTLC3B5MD39 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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GGTLC3B5MD39 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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GGTLC3B5MD39 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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GGTLC3B5MD39 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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GGTLC3B5MD39 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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GGTLC3B5MD39 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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GGTLC3B5MD39 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
GGTLC3B5MD39 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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