Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM5Q9C035 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM5Q9C035 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM5Q9C035 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM5Q9C035 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM5Q9C035 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TRIM5Q9C035 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRIM5Q9C035 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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