Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDK5RAP3Q96JB5 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms