Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EMBQ6PCB8 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EMBQ6PCB8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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