Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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RRN3P1Q2M238 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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RRN3P1Q2M238 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PTCD1-201ENST00000292478 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AL592490.1-201ENST00000409186 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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RRN3P1Q2M238 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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RRN3P1Q2M238 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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RRN3P1Q2M238 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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RRN3P1Q2M238 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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RRN3P1Q2M238 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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RRN3P1Q2M238 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 RALGPS2-203ENST00000367634 7512 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RRN3P1Q2M238 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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