Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms