Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ARID5AQ03989 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms