Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SERPINB8P1-201ENST00000401898 377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC245427.1-201ENST00000633705 760 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 Z92544.2-202ENST00000566927 407 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 KIR2DL4-203ENST00000357494 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC022634.2-201ENST00000521504 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TUBA3GP-201ENST00000410028 1325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 Z84721.1-201ENST00000438841 372 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 PDZRN3-AS1-203ENST00000608743 780 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCA2P51531 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms